Alternatív mintavételi módszer gyakorlati alkalmazhatósága madárgenetikai vizsgálatokban: parlagi sasok ivarmeghatározása, mikroszatellitákon alapuló egyedi azonosítása és mtDNS-ének vizsgálata | Alternative sampling methods in avian genetic studies: sexing, microsatellites based individual identification and mtDNA analyses of eastern imperial eagles (Aquila heliaca)
  • Metaadatok
Tartalom: http://real.mtak.hu/7006/
Archívum: MTA Könyvtár
Gyűjtemény: Status = Published
Type = Article
Cím:
Alternatív mintavételi módszer gyakorlati alkalmazhatósága madárgenetikai vizsgálatokban: parlagi sasok ivarmeghatározása, mikroszatellitákon alapuló egyedi azonosítása és mtDNS-ének vizsgálata | Alternative sampling methods in avian genetic studies: sexing, microsatellites based individual identification and mtDNA analyses of eastern imperial eagles (Aquila heliaca)
Létrehozó:
Vili, Nóra
Horváth, Márton B.
Kovács, Szilvia
Hornung, Erzsébet
Kalmár, Lajos
Dátum:
2009
Téma:
SV Veterinary science / állatorvostudomány
Tartalmi leírás:
A szerz?k az IsoCode STIX? papírból és a tollakból történ? mintavételi
módszert hasonlították össze, a kárpát-medencei parlagi sas (Aquila heliaca) begy?jtött
vedlett tollaiból és vérmintáiból végzett ivarmeghatározások, mikroszatellita fragmensanalízisek
és mtDNS haplotípus meghatározások eredményeinek felhasználásával.
A munka során, magyarországi és szlovákiai parlagisas-territóriumokból, a madarak zavarása
nélkül begy?jtött, 687 vedlett tollból, valamint 127, a szlovákiai fiókák gy?r?zésekor
vett vérmintából történt DNS-kivonás. Mindkét mintavételi módszer hatékonynak bizonyult
a genetikai vizsgálatokhoz, és a minták típusát tekintve (toll, ill. vér) gyakorlatilag
nem volt különbség a DNS-kivonás (93,6%, ill. 98,4%) és az ivarmeghatározás (96,3%, ill.
98,4%) hatékonyságában. A mikroszatellitafragmensek meghatározása során a vérminták
elemzésének 71,2%-a volt sikeres, míg a tollak esetében a szlovákiai mintákból lényegesen
kisebb arányú volt a sikeres meghatározás (13,6%), mint a hasonló hazai mintáknál
(100%), amelynek oka nagy valószín?séggel a tollak eltér? tárolási módjában kereshet?. A
mitokondriális DNS-szekvenciák elemzése során a megfelel?en tárolt, vedlett tollakból
származó minták nagyobb arányban bizonyultak használhatónak, mint a vérminták (sikerességi
arány 82,6%, ill. 29,2%).
Mivel mindkét vizsgált módszer jelent?sen leegyszer?síti a terepi mintavételt, és eredményeik
alapján mindkét eljárással megfelel? DNS nyerhet? ki a különböz? genetikai vizsgálatokhoz
(az egyes meghatározások eredményességét azonban jelent?sen befolyásolhatja
a mintavétel módszere és a minták tárolási módja), lehet?ség nyílik a fajtól (veszélyeztetettség,
kezelhet?ség), ill. a rendelkezésre álló anyagi lehet?ségekt?l függ?en választani a
két módszer közt. | In addition to conservation biological genetic studies, there is a growing need for the verification of the origin of animals and animal products. Sample collection is a serious problem in the case of wild, endangered or stress sensitive species. Non-invasive techniques are required by most of these species (shed hair, feathers, and droppings), while invasive methods (e.g. blood samples) can be applied only occasionally, when the animals are handled because of other reasons (i.e. medical examination, ringing, cleaning the cages). The stress caused by the collection of blood samples can be reduced by using a process designed for taking small amounts of blood for genetic examinations. One of these methods is the use of the IsoCode STIX (TM) paper. In this study the authors compared two sampling methods (shed feathers vs. IsoCode STIX (TM)) based on the results of DNA extraction, genetic sexing, DNA profiling and mitochondrial DNA sequencing of eastern imperial eagles of the Carpathian basin.
In their study they examined the DNA extracted from 687 shed feathers (collected without disturbing the animals) and 127 blood samples collected from Slovakian eagle chicks during the ringing procedure. Both methods proved to be efficient enough to retrieve DNA in adequate quality and quantity for genetic analyses. They found no significant difference between the two types of samples (feather and blood) in the efficiency of DNA extraction (93.6% and 98.4%) and sexing procedures (96.3% and 98.4%). 71.2% of the blood samples yielded a correct DNA-profile, while the results from feathers differed significantly according to the origin of samples. Only 13.6% of the Slovakian feather samples gave a proper DNA-fingerprint, while this ratio was 100% among the Hungarian samples. This difference can most likely be explained by the different storage conditions of feathers. The properly stored Hungarian shed feathers proved to be more usable than the blood samples in the analyses of the mitochondrial DNA sequences (82.6% vs. 29.2%).
According to their results, both sampling methods (shed feathers and blood samples collected on special impregnated paper) provide appropriate DNA for genetic examinations, furthermore the sampling is much simpler, and the tests can be performed quickly and precisely, however the efficiency differed according to the type of analyses, the collection method and the storage conditions.
Típus:
Article
PeerReviewed
Formátum:
text
Azonosító:
Vili, Nóra and Horváth, Márton B. and Kovács, Szilvia and Hornung, Erzsébet and Kalmár, Lajos (2009) Alternatív mintavételi módszer gyakorlati alkalmazhatósága madárgenetikai vizsgálatokban: parlagi sasok ivarmeghatározása, mikroszatellitákon alapuló egyedi azonosítása és mtDNS-ének vizsgálata | Alternative sampling methods in avian genetic studies: sexing, microsatellites based individual identification and mtDNA analyses of eastern imperial eagles (Aquila heliaca). Magyar Állatorvosok Lapja, 131 (7). pp. 426-435. ISSN 0025-004X
Kapcsolat: