Új, orvosbiológiai szempontból fontos moduláris fehérjék azonosítása, szerkezeti és funkcionális jellemzése = Identification and structure-function studies on novel medically important modular proteins
  • Metaadatok
Tartalom: http://real.mtak.hu/2042/
Archívum: MTA Könyvtár
Gyűjtemény: Status = Published

Type = Monograph
Cím:
Új, orvosbiológiai szempontból fontos moduláris fehérjék azonosítása, szerkezeti és funkcionális jellemzése = Identification and structure-function studies on novel medically important modular proteins
Létrehozó:
Patthy, László
Bányai, László
Nagy, Alinda
Trexler, Mária
Kiadó:
OTKA
Dátum:
2008
Téma:
QH3011 Biochemistry / biokémia
Tartalmi leírás:
A gerincesekre jellemző moduláris fehérjék kitüntetett orvosbiológiai jelentősége miatt fontos ezeknek a fehérjéknek az azonosítása, funkciójuk tisztázása. 1.) Az általunk korábban azonosított WFIKKN1 és WFIKKN2 multidomén fehérjék közül a WFIKKN2 -ről ismert, hogy kötődik miosztatinhoz. SPR mérésekkel jellemeztük a fehérjék és doménjeik kölcsönhatását miosztatinnal. NMR spektroszkópiával meghatároztuk a WFIKKN1 második Kunitz típusú doménjének térszerkezetét. Az SPR mérések, a KU2 domén térszerkezete és a korábbi enzimkinetikai méréseink eredményei alapján valószinűnek tűnik, hogy a WFIKKN1 fehérje is egy TGF-beta családba tartozó fehérje aktivitásának szabályozásában játszik szerepet. 2.) Meghatároztuk a Wnt jelátvitelben részt vevő WIF-1 fehérje WIF doménjének térszerkezetét. A domén térszerkezetét az immunoglobulin domének szerkezetére emlékeztető 8 beta redő által alkotott szendvics szerkezet és két alfa helix jellemzi. Az NMR spektroszkópiai térszerkezet meghatározásokat Gottfried Otting munkacsoportjával együttműködésben végeztük. 3.) A bioinformatikai módszerekkel azonosított gének jelentős hányadáról bizonyosodik be, hogy megjósolt szerkezetük téves. Módszert dolgoztunk ki olyan fehérjék azonosítására, melyek szerkezete ellentmond alapvető fehérjeszerkezeti törvényszerűségeknek. A módszer alkalmas abnormális fehérjeformák azonosítására és lehetőséget nyújt a génpredikciós eljárások minőségellenőrzésére. Az elemzés menete a http://mispred.enzim.hu honlapon megtalálható. | 1.) Recently we have identified two novel proteins (WFIKKN1 and WFIKKN2) one of which (WFIKKN2) has been shown to bind to myostatin and inhibit myostatin activity. We have shown that - similarly to the homologous protein - WFIKKN1 also binds to myostatin and thus may also participate in the regulation of the activity of TGF-beta family members. 2.) In collaboration with the NMR group of Gottfried Otting we have determined the three-dimensional structure of the WIF domain of Wnt- Inhibitory-Factor-1. The fold consists of an eight-stranded beta-sandwich reminiscent of the immunoglobulin fold. 3.) The predicted structure of a significant proportion of the computationally predicted genes is incorrect, therefore we have developed tools for the identification of mispredicted genes. The rationale of this approach is that a gene is suspected to be mispredicted if some features of the encoded protein conflict with our current knowledge about proteins. With the help of this tool we have shown that a significant proportion of mRNAs produced by alternative splicing encode non-viable, aberrant proteins with no physiological role.
Típus:
Monograph
PeerReviewed
Formátum:
application/pdf
Azonosító:
Patthy, László and Bányai, László and Nagy, Alinda and Trexler, Mária (2008) Új, orvosbiológiai szempontból fontos moduláris fehérjék azonosítása, szerkezeti és funkcionális jellemzése = Identification and structure-function studies on novel medically important modular proteins. Project Report. OTKA.
Kapcsolat: